II. Bayezid'in ordusuyla Yenişehir Muharebesi'nde yenilen Cem Sultan önce Konya'ya çekildi. Konya'da yeterince destek bulamayınca Tarsus'a, ardından Memlük sultanından aldığı davet üzerine Kahire'ye gitti.Buradan Mekke'ye giderek hac vazifesini yerine getirdi. Bu dönemde, ağabeyi II. Bayezid kendisine padişahlıktan vazgeçmesi halinde 1 milyon akçe vermeyi teklif etti. Ama Cem Sultan bu teklifi reddetti.Benzeri teklifler tekrar yapıldıysa da, bunlar da sonuç vermedi. Ve Cem Sultan meselesi, II. Bayezid döneminin en büyük sorunlarından biri olarak devleti uzun süre meşgul etti.
